Saltar al contenido

Що таке файл PDB?

5 de junio de 2021

Файл із розширенням файлу PDB – це, швидше за все, файл бази даних програми, який використовується для зберігання інформації про налагодження програми або модуля, наприклад файлу DLL або EXE. Їх іноді називають файлами символів. Файл відображає різні компоненти та оператори у вихідному коді до остаточного скомпільованого продукту, який потім налагоджувач може використовувати для пошуку вихідного файлу та розташування у виконуваному файлі, в якому він повинен зупинити процес налагодження. Натомість деякі файли PDB можуть мати формат файлу Protein Data Bank. Це текстові файли, що зберігають координати щодо білкових структур. Інші файли PDB, ймовірно, створюються у форматі файлу Palm Database або PalmDOC і використовуються з мобільною операційною системою PalmOS; деякі файли в цьому форматі використовують натомість розширення .PRC. Ще одним можливим форматом є Tanida Demo Builder.

Змістовий покажчик

Як відкрити файл PDB

Різні програми використовують власний файл PDB для зберігання даних у якомусь форматі структурованої бази даних, тому кожна програма використовується для відкриття власного типу. Geneious, Quicken, Visual Studio та Pegasus – лише кілька прикладів програм, які можуть використовувати файл PDB як файл бази даних. Radare та PDBparse також можуть працювати. Деякі файли PDB зберігаються у вигляді простого тексту, як-от файли бази даних налагодження програми Geneious, і повністю читаються людиною, якщо їх відкрити в текстовому редакторі. Ви можете відкрити цей файл PDB будь-якою програмою, яка може читати текстові документи, наприклад, вбудованою програмою Notepad у Windows. Деякі інші переглядачі та редактори файлів PDB включають Notepad ++ та Brackets. Інші файли PDB не є текстовими документами і корисні лише тоді, коли їх відкриває програма, для якої вона призначена. Наприклад, якщо ваше пов’язане якимось чином із Quicken, спробуйте використати це програмне забезпечення для його перегляду або редагування. Visual Studio очікує побачити файл PDB у тій самій папці, що і файл DLL або EXE. За допомогою Avogadro ви можете переглядати та редагувати файли PDB, які є файлами Protein Data Bank, у Windows, Linux та macOS. Ці програми також можуть відкрити файл: Jmol, RasMol, QuickPDB та USCF Chimera. Оскільки це звичайний текст, його також можна відкрити в текстовому редакторі. Palm Desktop повинен мати можливість відкрити цей файл, якщо він знаходиться у форматі файлу бази даних Palm, але, можливо, вам доведеться спочатку перейменувати його, щоб мати розширення файлу .PRC, щоб ця програма його розпізнала. Калібр – ще один варіант. Щоб відкрити PDB-файл PalmDOC, спробуйте STDU Viewer. Файли Tanida Demo Builder відкриваються за допомогою програми, що носить те саме ім’я.

Як конвертувати файл PDB

Файли програмних баз даних, швидше за все, не можуть бути перетворені в інший формат файлів, принаймні не за допомогою звичайного інструменту конвертера файлів. Натомість, якщо є який-небудь інструмент, який може перетворити такий тип файлів, це буде та сама програма, яка може його відкрити. Наприклад, якщо вам потрібно перетворити файл бази даних із Quicken, спробуйте скористатися цією програмою. Однак цей тип перетворення, мабуть, мало корисний, але й не підтримується в цих програмах баз даних (тобто, ймовірно, вам не потрібно перетворювати цей тип PDB-файлу в будь-який інший формат). Файли білкового банку даних можна конвертувати в інші формати за допомогою MeshLab. Для цього вам, можливо, доведеться спочатку перетворити його у WRL за допомогою PyMOL з Файл > Зберегти зображення як > VRML , а потім імпортуйте файл WRL у MeshLab і використовуйте файл Файл > Експортувати сітку як меню, щоб остаточно перетворити файл PDB на STL або інший формат файлу. Якщо вам не потрібно, щоб модель була кольоровою, ви можете експортувати файл безпосередньо в STL за допомогою USCF Chimera (посилання для завантаження знаходиться вище). В іншому випадку ви можете використовувати той самий спосіб, що і вище (з MeshLab), щоб перетворити PDB у WRL за допомогою USCF Chimera, а потім експортувати WRL у STL за допомогою MeshLab. Перетворити PDB у PDF або EPUB, якщо у вас є файл PalmDOC, можна кількома способами, але найпростіший – це, мабуть, використання онлайн-конвертера, такого як Zamzar. Ви можете завантажити свій файл на цей веб-сайт, щоб мати можливість перетворити його в ці формати, а також у формати файлів AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT та інші. Перетворити файл PDB у формат FASTA можна за допомогою онлайн-конвертера PDB у FASTA від Lailer Lab. Цей файл також можна перетворити в CIF (формат кристалографічної інформації) в Інтернеті за допомогою PDBx / mmCIF.

Все ще не можете відкрити файл?

Файли, які не відкриваються жодним із інструментів зверху, ймовірно, насправді не є файлами PDB. Можливо, трапляється так, що ви неправильно читаєте розширення файлу; деякі формати використовують суфікс, який дуже нагадує PDB, коли вони насправді не пов’язані між собою і працюють однаково. Наприклад, файл PDF – це файл документа, але більшість програм зверху не відображатимуть текст та / або зображення правильно, якщо ви намагаєтесь відкрити їх за допомогою цих програм. Те саме стосується інших файлів із подібними розширеннями файлів, таких як DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO та WPD. PBD – це ще одна програма, яка належить до програми EaseUS Todo Backup, і тому корисна лише при відкритті за допомогою цього програмного забезпечення. Якщо у вас немає файлу PDB, дослідіть розширення файлу, яке має ваш файл, щоб ви могли знайти відповідну програму, яка відкриває або конвертує його.

Розширене читання на файлах PDB

Ви можете прочитати набагато більше про файли програмних баз даних від GitHub та Wintellect. Дещо більше можна дізнатись і про файли Банку білкових даних; див. Всесвітній банк даних про білки та ПБК RCSB.

Питання що часто задаються

  • Як це виправити, коли Visual Studio не може знайти або відкрити файли PDB? Якщо ви бачите повідомлення про те, що Visual Studio не може знайти або відкрити файл PDB, спробуйте скористатися засобом налагодження Visual Studio. Йти до Інструменти > Варіанти > Налагодження > Символи і виберіть Сервери символів Microsoft.
  • Як відкрити файл PDB на Android? Щоб відкрити файл PDB на Android, скористайтеся стороннім пристроєм для зчитування файлів. Завантажте програму Cool Reader або будь-яку іншу програму для читання файлів PDB у Google Play.